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泮托拉唑硫醚的提纯多采用重结晶、酸溶碱析工艺，过程中的稳定性需重点控制温度、pH及干燥方式。
重结晶稳定性
选用甲醇 - 水混合溶剂重结晶时，加热温度需控制在50~60℃，温度过高（＞80℃）会导致晶体表面氧化，颜色由类白色变为淡黄色；重结晶冷却速率需缓慢（1~2℃/min），快速降温易形成亚稳态晶体，储存过程中易结块变质。
酸溶碱析稳定性
利用杂环质子化特性进行酸溶碱析时，酸液浓度需控制在0.1~0.2mol/L（盐酸或硫酸），强酸高浓度会导致硫醚键微量氧化；碱析时宜选用氨水调节pH至7~8，避免使用氢氧化钠等强碱，防止局部 pH 过高引发杂环开环。
干燥过程稳定性
干燥方式优先选择真空干燥（温度40~50℃，真空度-0.08MPa） 或喷雾干燥（进风温度100~110℃，出风温度50~60℃），可快速去除水分且不破坏结构；严禁采用烘箱常压高温干燥（＞80℃），否则会导致硫醚键氧化、晶体碳化。